Деятельность центра осуществляется следующими структурными подразделениями:
Отдел профессионального развития педагогических кадров (micro learning)
Сектора отдела:
Диагностико-аналитический
Диспетчерский
Организационно-методический
Отдел реализации проектов (программ) в области образования
Отдел мониторинговых исследований
Отдел организации конкурсов и мероприятий